Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL2Q92772 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms