Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRQ92752 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRQ92752 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRQ92752 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRQ92752 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNRQ92752 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNRQ92752 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNRQ92752 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNRQ92752 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNRQ92752 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TNRQ92752 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRQ92752 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRQ92752 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRQ92752 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRQ92752 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRQ92752 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRQ92752 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRQ92752 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRQ92752 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRQ92752 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRQ92752 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRQ92752 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRQ92752 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRQ92752 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRQ92752 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
TNRQ92752 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRQ92752 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRQ92752 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRQ92752 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRQ92752 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRQ92752 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRQ92752 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRQ92752 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRQ92752 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRQ92752 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRQ92752 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRQ92752 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRQ92752 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRQ92752 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRQ92752 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRQ92752 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRQ92752 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNRQ92752 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNRQ92752 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNRQ92752 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNRQ92752 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNRQ92752 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TNRQ92752 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRQ92752 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRQ92752 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRQ92752 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRQ92752 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms