Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCSTNQ92542 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NCSTNQ92542 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms