Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMPDL3AQ92484 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms