Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY2Q8WXA3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY2Q8WXA3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms