Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBR1Q8WVP7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms