Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX29Q8TEQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms