Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRSK1Q8TDC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRSK1Q8TDC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms