Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDM1Q8TC05 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDM1Q8TC05 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms