Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNIH3Q8TBE1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms