Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHDC4Q8TBB5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC4Q8TBB5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms