Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HELBQ8NG08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HELBQ8NG08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms