Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL2Q8NEU8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms