Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NHLRC2Q8NBF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NHLRC2Q8NBF2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms