Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC63Q8NA47 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC63Q8NA47 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms