Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C15orf54Q8N8G6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C15orf54Q8N8G6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms