Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN19Q8N6F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms