Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RNF182Q8N6D2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RNF182Q8N6D2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF182Q8N6D2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RNF182Q8N6D2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RNF182Q8N6D2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RNF182Q8N6D2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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RNF182Q8N6D2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RNF182Q8N6D2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RNF182Q8N6D2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF182Q8N6D2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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