Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFAF2Q8N183 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFAF2Q8N183 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms