Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms