Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms