Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms