Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms