Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PLD3Q8IV08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLD3Q8IV08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms