Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS6Q8IU80 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS6Q8IU80 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms