Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALYREFQ86V81 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms