Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP7Q86V35 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CABP7Q86V35 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CABP7Q86V35 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CABP7Q86V35 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms