Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF39Q86UA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms