Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG4DQ86TL0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms