Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RD3Q7Z3Z2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3Q7Z3Z2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3Q7Z3Z2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms