Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ZFYVE16Q7Z3T8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZFYVE16Q7Z3T8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZFYVE16Q7Z3T8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms