Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LYSMD3Q7Z3D4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYSMD3Q7Z3D4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms