Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
NUP54Q7Z3B4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP54Q7Z3B4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms