Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms