Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms