Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPGS1Q6ZTW0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms