Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM43BQ6ZT52 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms