Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TBC1D9Q6ZT07 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TBC1D9Q6ZT07 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TBC1D9Q6ZT07 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TBC1D9Q6ZT07 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TBC1D9Q6ZT07 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TBC1D9Q6ZT07 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TBC1D9Q6ZT07 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TBC1D9Q6ZT07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms