Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00299Q6ZSB3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms