Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS1Q6VY07 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms