Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATF7IPQ6VMQ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATF7IPQ6VMQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATF7IPQ6VMQ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms