Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSTM1Q6UX27 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VSTM1Q6UX27 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms