Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBR1LQ6UX01 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LMBR1LQ6UX01 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1LQ6UX01 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms