Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCLAT1Q6UWP7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LCLAT1Q6UWP7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms