Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW63

KDELC1, KDEL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELC1Q6UW63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDELC1Q6UW63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDELC1Q6UW63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms