Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX4L9Q6RFH8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms