Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC25A47Q6Q0C1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms