Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL35Q6PF15 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms