Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMBQ6PCB8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EMBQ6PCB8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms