Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PKN3Q6P5Z2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKN3Q6P5Z2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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